sink関数を使うと画面に出力される結果をファイルに保存できます。

sink("./filename.txt")
1:5        # ファイルに結果出力させたいコマンド
sink()

<ファイルの出力結果>

[1] 1 2 3 4 5

ファイルに追記する場合は、append=TRUEとします。(デフォルトはFALSEで上書き)